Возможно ли в ЗУП выполнить ручную корректировку доходов для обложения взносами?

Да, документ Перерасчет взносов, на вкладке доходы можно добавить строки отдельно по месяцам, например если нужно уменьшить базу за декабрь и увеличить базу ноябрь можно добавить строку с суммой с минусом за декабрь и с плюсом за ноябрь.