Что такое регистр №3 (ЕГАИС) и как с ним работать? Второго регистра больше не будет? При подтверждении накладных по-старому нам необходимо сделать передачу н 2й регистр?

В ЕГАИСе существует три регистра:
1 регистр - алкогольная продукция хранится в разрезе справок 2;
2 регистр - алкогольная продукция хранится только в разрезе алкогольной продукции;
3 регистр = алкогольная продукция хранится в разрезе справок 2 с привязкой к акцизным маркам и существует только в контексте с 1 регистром.

2 регистр пока "не изчезает", он остается для немаркируемой алкогольной продукции (пиво, сидр...), а также маркируемого алкоголя произведенного до 1 июля.

Также если вы в переходный период (март-июнь) принимаете накладные по-старому (без акцизных марок), то вам необходимо делать передачу в регистр 2.

При подтверждении ТТН в 3-ем формате с считыванием акцизных марок алкогольная продукция будет увеличивать два регистра

1 регистр (по справкам2) и 3 регистр (по каждой акцизной марке). При продаже такого алкоголя, автоматически будет списываться продукция с 1 регистра и 3 регистра.

Но на данный момент пока в ЕГАИСе есть сложности и алкогольная продукция списывается только с 1го регистра. Но ФС РАР заявили о том, что до 15 марта все исправят