Если в одном акте об оказании услуг указаны услуги по ремонту и приобретенные запчасти для автобуса? мы услуги приходуем отдельно, запчасти отдельно? И оплачиваем также по отдельности в СУФД?

Если запчасти передаются отдельной накладной и приходуются отдельно на склад, а потом списываются на ремонт- на зап.части Поступление МЗ, иначе можно все включать в услуги (в БГУ поступление услуг, работ). Оплачивать в любом случае все вместе.