При создании номенклатурной единицы, поступившего товара, ссылка для создания счетов учета номенклатуры отсутсвует, как в данном случае задать счет учета?

Создавать из справочника номенклатура.
К каждой номенклатуре можно не создавать счета учета, достаточно создать на номенклатурную группу.
При создании номенклатуры, будет присваиваться счет номенклатурной группы.