Можно ли вывести информцию по взносам по доп. тарифам в резрезе подразделений?

Такой возможности нет. Взносы собираются по физическим лицам. Как вариант можно в отчете Анализ взносов в фонды сделать настройку с отбором по сотрудникам и настроить список с отбором по подразделению. Будет информация только по тем физлицам, которые на текущий момент работают в выбранном подразделении. В итоге могут быть несоответствия.