Если менять в графике работы сотрудников график, по которому считается норма времени, заполнение табличной части сбивается. Можно поменять график, по которому считается норма так, чтобы табличная часть не перезаполнялась?

Можно, для этого перейти в раздел Администрирование - Обслуживание - Корректировка данных - Выбрать Графики работы сотрудников - В отборе добавить - Ссылка - Выбрать нужный график - Указать правильный график полного рабочего времени.