В одной ТТН ЕГАИС поступил товар Виски обычный и в подарочной упаковке (2 стакана). Как правильно принять их? Ведь у них цены разные?

Вам необходимо создать две карточки номенклатуры, например, первая - Виски, вторая Виски+2стакана.
В ТТН ЕГАИС на закладке "Товары" в поле "Номенклатура" напротив нужной алкогольной позиции и нужной цены, выбрать верную позицию.
После этого проверить марки и создать документ Поступление товаров.
В следующий раз, когда поступит виски, вам в ТТН ЕГАИС необходимо будет выбрать либо просто Виски либо Виски +2 стакана.