Как, подписанный по внутреннему ЭДО документ, передать вышестоящей организации для подписания, к примеру "Акт о приеме-передаче объектов нефинансовых активов" ?

Рекомендуем настроить внешний ЭДО, подписать и отправить внешний произвольный электронный документ
К примеру: в учреждении подписывать документ "Акт о приеме-передаче объектов нефинансовых активов" средствами внутреннего ЭДО, сохранить представление в PDF и отправить его в виде произвольного электронного документа контрагенту( (Внутр.ЭДО - Просмотреть электронный документ / Файл - Сохранить как / Тип файла *.pdf).)
Подробнее: https://its.1c.ru/db/metbud81#content:6176:hdoc:_toc431808261