Как провести списание с р/сч по новым сотрудникам по ведомостям, чтобы это было отдельное перечисление? По старым сотрудникам копирую платежку и корректирую сумму, а по этим не получается.

Два варианта:
1. скопировать платежку старого сотрудника и внести туда данные нового и сумму по нему, в след. раз так же копировать эту платежку.
2. Сформировать платежку в БП и выгрузить в онлайн-банк.