Как удалить сохраненный аналитический отчет, который уже не используется в ЗУП 3.1?

Пометить на удаление ненужный отчет можно только непосредственно в справочнике Отчеты, перейти в него можно из любого раздела, к примеру Кадровые отчеты, внизу гиперссылка Все отчеты...  

Далее в поисковике можно написать наименование отчета и пометить его на удаление. Затем через Администрирование-Обслуживание -Удаление помеченных объектов найти отчете в разделе Отчеты и удалить его