При создании услуги в номенклатуре подтягивается цена продажи и поэтому при следующем создании счета программа "тянет" эту цену. Можно как-то убрать эту функцию?

Цена продажи автоматически подставляется в документы из предыдущего документа, либо из карточки номенклатуры. Это можно настроить в разделе Администрирование-Параметры учета-Заполнение цен продажи.

Можно также воспользоваться документом Установка цен номенклатуры, если цена реализации отличается для разных групп контрагентов.