Как в 1С: Бухгалтерия предприятия 3.0 отключить "Безопасность обмена с банком" при выгрузке платежных поручений, чтобы они не удалялись из каталога?

 Данный механизм предназначен для того, чтобы платежное поручение, загруженное в клиентбанк полностью соответствовало учётному документу.

Если он доставляет неудобства, его можно отключить, перейдя в раздел Банк и касса - Банковские выписки - Еще - Обмен с банком.
В нижней части открывшейся формы находится кнопка "Настройки".

В открывшемся окне нужно снять флаг "Безопасность обмена с банком" и нажать "Сохранить и закрыть"