В связи с реорганизацией ООО в форме преобразования "старое" юр.лицо снято с регистрации, срок действия сертификата электронной подписи истек, как теперь подать Баланс(бухгалтерскую отчетность) за истекший год?

Как правоприёмник, реорганизованная организация может подать отчет от своего имени за реорганизованное лицо.

Для того, чтобы выполнить это в программе 1С: Бухгалтерия, достаточно создать копию информационной базы и в ней ввести данные о "новом" юридическом лице и подключить сервис 1С-Отчетность.
В зависимости от способа перехода в новую информационную базу (обычная копия, либо ввод остатков в чистую) Вы можете сформировать бухгалтерскую отчётность в одной из баз.

В случае начала ведения учета "с нуля" с вводом остатков, необходимо сформировать отчет в старой информационной базе, проверить корректность заполнения данных, а затем выгрузить его, нажав соответствующую кнопку в списке отчетности или в форме отчета.

Выгруженный файл нужно в той же форме загрузить в новую информационную базу, в которой введены данные новообразованной организации, выбрав пункт "Отчёт".

После выбора периода и вида отчета, и нажатия кнопки "Загрузить" Баланс появится в списке отчетности, реквизиты организации автоматически заменятся на новые, все, что нужно будет сделеать - звонком уведомить контролирующий орган о том, что отчёт сдаётся за реорганизованную организацию и прикрепить на странице "Дополнительные файлы" пояснения с дублированием этой информации в формате PDF.