У сотрудника есть второй ребенок-инвалид, должен ли суммироваться вычет как на второго ребенка 2800 руб + ребенок-инвалид 12000руб? Как в программе ЗКГУ 3.1 это отразить?

Поскольку законодатель явно не описал порядок расчета НДФЛ в таких ситуациях, а разработчик не наделен правом законотворчества, принять "правильное" решение (перейти на суммирование двух вычетов на ребенка-инвалида) предлагается пользователю самостоятельно принять решение исходя из собственного профессионального суждения