Если делать удержание через документ Удержание по прочим операциям, сумма в увольнение попадает, но вид расчетов ставится ОТ а должна быть ПР. Как настроить?

Можно настроить через значение показателя. В настройках удержания поставить Выполняется только если введено значение показателя. Создать показатель Прочее удержание, ввести формулу (РасчетнаяБаза*0)+ПрочееУдержание. Настроить шаблон указать сумму удержания и пересчитать увольнение.