Можно ли сделать сверку с ФНС непосредственно из БГУ?

Да. В версии БГУ 2.0.101.55 добавлена возможность включения режима сверки с ФНС в личном кабинете ЕНС (раздел Учет и отчетность) Если переключатель "Режим сверки" включен, рабочее место работает в режиме сверки данных расчетов по ЕНС в учетной системе налогоплательщика с данными из личного кабинета ФНС. Реализовано сопоставление данных следующих разделов: - Платежи - Декларации, уведомления В разделе "Платежи" выводится информация о пополнении счета посредством единых налоговых платежей по данным ФНС и по данным организации. В разделе "Декларации, уведомления" осуществляется сверка сведений об отправленных в ФНС через сервис 1С:Отчетность налоговых декларациях или регламентированных уведомлений с данными ФНС.