В ведомость попадает сумма за прошлые годы. В расчетную ведомость т-51 показывает долг одновременно за сотрудником и за организацией на одинаковую сумму. Выводит расчетный листок по уволенному сотруднику.

Причиной может быть ошибочное заполнение ведомости прошлого периода(зачастую ручное), где отсутствуют ссылки на документ начисления. В каждой ведомости в составе выплаты должны быть заполнены реквизиты "Документ-основание", "Статья расходов", "Вид дохода". При автоматическом заполнении на основании начислений программа заполняет всё необходимое, при ручном заполнении это может быть пропущено или перепутано(некорректно указан сотрудник, если несколько рабочих мест, не указали документ-основание и т.д.). В виду этого в регистрах по заработной плате к выплате может произойти несостыковка. 

Чтобы исправить подобное нужно либо проанализировать и найти в каком периоде появилась данная ошибка и исправить ведомость. Либо создать записи в документе "Перенос данных" ручные операции по зарплатным регистрам "Зарплата к выплате", "Бухгалтерские взаиморасчеты с сотрудниками", "Взаиморасчеты с сотрудниками".