Организация на СЭЗ, есть руководитель, который не получает заработную плату, по нему начисление страховых взносов производится по документу Регистрация облагаемой базы руководителя. Почему в марте в этом документе стоит не 2 059,07, а 2 059,06?

Т.к. предприятие на СЭЗ, ставка страховых взносов - 7,6%, при расчете за несколько месяцев при применении принципа расчета нарастающим итогом согласно положений ст. 286 НК РФ может возникнуть необходимость выравнивания расчета путем уменьшения исчисленных страховых взносов. 

Рассмотрим пример: МРОТ 27 093, ставка СЭЗ - 7,6 %.

Расчет взносов за январь: база для расчета 27 093, сумма исчисленных взносов составит 2 059,07.

Расчет взносов за Февраль: общая сумма базы для расчета СВ уже будет 54 186 (27 093 + 27 093), общая сумма исчисленных СВ - 4 118,14, ранее учтенные - 2 059,07, остаток 2 059,07.

А за три месяца общая база составит 81 279, общая сумма исчисленных СВ нарастающим итогом - 6 177,20, ранее учтенные - 4 118,14, остаток - 2 059,06. Документом Регистрация налогооблагаемой базы за Март исчислено 2 059,06. 

Проверить корректность расчетов можно в отчете Проверка расчета взносов.