Здравствуйте, подскажите, пожалуйста, как в конце года и должен ли закрываться сч.63 "Резерв по сомнительным долгам" в 1С Бухгалтерия.

Если в 63 счете есть начисления / остатки по контрагентам, по которым нет остатков на 62 счете, то нужно провести ряд действий:
1. Сформировать оборотно-сальдовую ведомость по счету 62 по контрагенту в разрезе договоров и документов расчетов за интересующий нас период (можно на последний день такого периода). Обычно в такой ситуации в целом по счету остатка нет, а в детализации могут быть равные остатки по дебету и по кредиту но по разным договорам/документам расчетов.
2. Необходимо исправить остатки. Если это редактируемый период, то достаточно правильно закрыть документы в разрезе договоров и документов расчетов (зачастую просто перепровести в хронологическом порядке). Если период не редактируемый (закрытый), то в доступном периоде необходимо создать документ "Корректировка долга" (Панель разделов - Продажи - Панель навигации - Расчеты с контрагентами - Корректировка долга). Вид документа "Прочая корректировка", дебитор и кредитор - выбираем нашего контрагента, на закладках "Дебиторская/Кредиторская задолженность" нажимаем заполнить. Проверяем, что бы подтянулись договора и документы по которым "зависла" задолженность. Провести и закрыть.
3. Проверить по оборотно-сальдовой ведомости по сч.62, что остатка на конец периода не осталось.
4. При проведении регламентных операций по закрытию месяца по счету 63 будут проведены все проводки по корректировке резервов сомнительных долгов, в том числе и по налоговому учету.