В 1С УНФ есть возможность вести учет прослеживаемых товаров?

Да, для этого необходимо в настройках включить соответствующий функционал:
Настройки-Еще больше возможностей-Закупки-Импорт- поставить галки Грузовые таможенные декларации и Прослеживаемые товары
После этого в карточке номенклатуры появится возможность на вкладке "Закупка производство" указать Код ТН ВЭД и в нем указать признак "Прослеживаемый"