Как в 1С: Бухгалтерия предприятия 3.0(БП) сделать начисления по договору ГПХ?

Для корректного учёта договоров подряда в программе нужно включить соответствующую функциональность.

Перейдите в раздел Администрирование - Функциональность

В открывшейся форме выберите элемент списка "Сотрудники" и установите флаг "Договоры подряда"

В разделе Зарплата и Кадры появится подраздел Договоры подряда

Также станет доступным создание договоров подряда из справочника Сотрудники.

В форме документа укажите Сотрудника(для оформления договора нужно внести физическое лицо в справочник "Сотрудники", однако это не значит, что он будет числиться в штате).
Далее установите срок действия договора, периодичность расчетов - Ежемесячной или Одной суммой в конце срока действия договора, а также сумму выплат. Также для отражения в ЕФС-1 Нужно указать Код вида деятельности (ОКЗ)

Также, если затраты по выплатам нужно относить на счет учета или статью затрат/подразделение, отличное от основных, используемых в предприятии, нужно указать их по ссылке "Учет расходов", выбрав соответствующий способ отражения

После проведения документа в начислении зарплаты с видом "Окончательный расчет" Автоматически заполнится сумма начисления, если выбран способ ежемесячного расчета.