Сбиваются счета учета в документах поступлений и реализаций в 1С: Бухгалтерия предприятия 3.0

Для корректной подстановки счетов учета номенклатуры в БП есть одноименный регистр сведений.
По умолчанию для всех видов номенклатуры определены счета учета.
(Справочники - Номенклатура - Гиперссылка "Счета учета номенклатуры")

Это означает, что для всей номенклатуры с определенным видом будет по умолчанию определяться конкретный счет учета.
Для того, чтобы из раза в раз не менять счета учета в документах вручную, рекомендуем настроить отдельные правила определения счетов учета.
Например в нашем случае Вид номенклатуры "Материалы" имеет предопределенный счет учета 10.01.
При этом деятельность предприятия связана с автотранспортом и ведется учет запасных частей и агрегатов.
В первую очередь в справочнике Номенклатура нужно создать группу с тем же названием и переместить всю номенклатуру в группу для простоты дальнейшей работы.

Выделяем элементы справочника номенклатуры, относящиеся к группе, которую мы создали, нажимаем ПКМ  - Переместить в группу

Выбираем группу "Запчасти" 

Убеждаемся, что позиции оказались в нужной группе.

Переходим в "Счета учета номенклатуры" и нажимаем "Создать"

В поле "Вид номенклатуры" выбираем материалы. В поле номенклатура нажимаем "Показать все" и выбираем ранее созданную группу при помощи кнопки выбрать. В отличие от большинства других отборов, здесь программа позволит Вам выбрать группу, а не элемент.

Заполняем счет учета, при необходимости счет передачи, счета доходов и расходов, а также НДС. Если создаваемое правило касается конкретной организации или склада, а для всех других правила определения счетов учета будут другими, указываем их в соответствующих строках.

При нажатии кнопки "Записать и закрыть" будет создана новая строка. Теперь в документах при выборе номенклатуры с Видом Материалы из Группы Запчасти счета учета будут автоматически определяться в соответствии с настройкой.