Как оформить в ЗУП выплату Ежемесячного пособия по уходу за ребенком до 1,5 лет на папу, а фактическое отсутствие по уходу за ребенком - на маму?

Подобная схема реализуема, необходимо правильно оформлять документы и соблюдать последовательность отправки сведений по системе СЭДО.
Разберем ситуацию на примере.
После рождения ребенка семья приняла решение об оформлении выплат ежемесячного пособия по уходу за ребенком до 1,5 лет на отца, как получателя большего дохода. Соответственно, в программе необходимо оформить Отпуск по уходу за ребенком.
Внесем данные в карточку сотрудника в раздел Семья:

Сформируем и проведем документ Отпуск по уходу за ребенком.

Прямо из документа Отпуск по уходу за ребенком с вкладки Прямые выплаты ФСС по кнопке Исходящее сообщение о страховом случае (СЭДО) сформируем и подготовим к отправке инициацию процесса по пособию (сообщение 109).

Как только будет получен Входящий запрос по расчету пособия - сформировать и отправить Ответ на входящий запрос. 

Далее, сформируем и отправим отчет ЕФС-1 подраздел 1.2 с типом сведений Назначение выплат ОСС.

Не ранее следующего дня оформляем Возврат из отпуска. 

Начиная с даты возврата папе начнет начисляться заработная плата. Уведомление о прекращении отпуска либо другой отчет отправлять не нужно.

В это время работодатель мамы оформляет у себя в программе такой же Отпуск по уходу за ребенком до 1,5 лет, но не формирует и не отправляет никакие отчеты и уведомления - данным документом фиксируется ее фактическое отсутствие.

Таким образом выплата пособия останется закрепленной за отцом, а функции разделятся между родителями, как они это и запланировали.