Создали "Корректировку реализации", но почему товар на складе поменялся? Изначально была оформлена Реализация товаров на 10 штук. Но выяснили. что мы отгрузили не 10 штук, а 12 штук и оформили Корректировку реализации. Что мы сделали не так?

У вас в карточке Склада включена опция "Использовать ордерный склад при излишках и недостачах"
Поэтому вы должны создать Корректировку реализации. И программа по регистру "Товары организации" отминусует 2 штуки.
А затем вы должны либо оформить "Пересчет товаров" и там указать, что по факту вы не нашли 2 штук, либо создать документ "Ордер на отражение недостач".
Эти два документа по регистру "Товары на складах" отминусуют 2 штуки товара