Если есть отрицательный остаток в расчетах с контрагентами , то надо править документами?

По-разному. Если ошибки тянутся из закрытого периода, то помогает документ Корректировка долга, созданный в текущем периоде. Можно начать с вида Прочие корректировки, при необходимости использовать другие виды операции. В каждом случае свой рецепт. Этот способ самый предпочтительный, т.к. документ схлопывает хвосты в разрезе документов расчетов.