Перешли на ЗКГУ 3 с 01.01.2017, всем сотрудникам поставили дату приема 01.01.2017, если сотрудник принят до 01.01.2017г. В отпуске не можем указать отработанные дни и суммы для расчета среднего. Как это можно сделать в программе?

Изменить даты приемов на реальные. После этого можно внести средний заработок по месяцам за прошлый период по кнопке Средний заработок. Если не менять даты приемов, можно рассчитать средний вручную и внести готовую сумму в результат расчета.